2008 год – создание лаборатории на базе лаборатории анаэробного метаболизма микроорганизмов (зав. лабораторией проф. В.К. Акименко) в качестве части Отдела Всероссийская коллекция микроорганизмов.

Руководитель – д.б.н. Виктория Артуровна Щербакова

vshakola@gmail.com

• поиск, выделение, описание и изучение анаэробных бактерий и архей из экстремальных мест обитания - содовых озер, грунтов и криопэгов вечной мерзлоты Арктики, экосистем Антарктиды, морских и пресноводных донных осадков;

• исследование некультивируемого разнообразия анаэробных микроорганизмов в экстремальных местах обитания с использованием молекулярно-экологических методов;

• изучение метаногенных архей в качестве модельных микроорганизмов для решения проблем астробиологии;

• описание новых таксонов анаэробных бактерий обитателей человека и животных;

• изучение возможностей применения анаэробных бактерий и архей в биотехнологии, в том числе, для получения биоводорода и биогаза, антифризных белков и холодоустойчивых ферментов.

Основные достижения

Сотрудники лаборатории принимали участие в пионерском исследовании микробных сообществ хлоридно-натриевых рассолов (криопэгов) в многолетнемерзлых отложениях

Возраст отложений 6-120 тыс. лет. Криопэги остаются жидкими при температуре in situ от -9 до -11^оС и представляют собой единственное место на Земле, характеризующееся постоянной отрицательной температурой, высокой соленостью и изолированностью от воздействия внешних факторов. Создана коллекция новых  анаэробных и факультативно-анаэробных психрофильных и психротрофных микроорганизмов.

С использованием методов молекулярной экологии впервые получены данные о разнообразии архей в образцах вечной мерзлоты Арктики

Характеризуется постоянными отрицательными температурами, возраст от 6 до 25 тысяч лет. Анализ клоновых библиотек архейных генов 16S рРНК и mcrA показал, что во всех исследованных образцах археи филума Euryarchaeota преобладали над представителями Crenarchaeota. Метаногенные археи были представлены новыми таксонами порядков Methanomicrobiales, Methanobacteriales, Methanococcales и Methanocelles.

Выделены и описаны новые таксоны анаэробных бактерий и архей из различных мест обитания:

• 4 рода, 8 видов бактерий из микробиома человека;

• 6 видов бактерий из содовых озер;

• 1 род и 4 вида бактерий из глубинной биосферы и морских экосистем;

• 5 видов бактерий и 3 вида архей из образцов вечной мерзлоты Арктики.

Получены приоритетные данные подтверждающие возможность выживания метаногенных архей в условиях космоса:

При длительной экспозиции (24 мес) метаногенных архей Methanosarcina mazei S-6^T на внешней стороне Международной космической станции (МКС) сохранилась жизнеспособная популяция клеток археи. На основании полученных результатов можно сделать вывод о наличии в геноме метаногенной археи M. mazei S-6^T протекторных механизмов от воздействия факторов космического пространства в том числе таких, как вакуум, УФ-облучение и перепады температур.

В лаборатории поддерживается в жизнеспособном состоянии часть фонда ВКМ

более 500 штаммов трудно культивируемых видов анаэробных бактерий и архей, в основном, выделенных из экстремальных мест обитания.

Речкина В., научный сотрудник лаборатории анаэробных микроорганизмов участвует в отборе проб вечной мерзлоты на Чукотке. Экспедиция лаборатории криобиологии почв (рук. Ривкина Е.М.) ИФХиБПП РАН.

4 – защищено кандидатских диссертаций

1 – защищена докторская диссертация

140 – статей опубликовано

3 – патента получено

16 – проектов выполнено: по грантам международных и российских фондов, соглашениям Минобрнауки.

• поиск, выделение, описание и изучение анаэробных бактерий и архей из экстремальных мест обитания - содовых озер, грунтов и криопэгов вечной мерзлоты Арктики, экосистем Антарктиды, морских и пресноводных донных осадков;

• исследование некультивируемого разнообразия анаэробных микроорганизмов в экстремальных местах обитания с использованием молекулярно-экологических методов;

• изучение метаногенных архей в качестве модельных микроорганизмов для решения проблем астробиологии;

• описание новых таксонов анаэробных бактерий обитателей человека и животных;

• изучение возможностей применения анаэробных бактерий и архей в биотехнологии, в том числе, для получения биоводорода и биогаза, антифризных белков и холодоустойчивых ферментов.

Основные достижения

Сотрудники лаборатории принимали участие в пионерском исследовании микробных сообществ хлоридно-натриевых рассолов (криопэгов) в многолетнемерзлых отложениях

Возраст отложений 6-120 тыс. лет. Криопэги остаются жидкими при температуре in situ от -9 до -11^оС и представляют собой единственное место на Земле, характеризующееся постоянной отрицательной температурой, высокой соленостью и изолированностью от воздействия внешних факторов. Создана коллекция новых  анаэробных и факультативно-анаэробных психрофильных и психротрофных микроорганизмов.

С использованием методов молекулярной экологии впервые получены данные о разнообразии архей в образцах вечной мерзлоты Арктики

Характеризуется постоянными отрицательными температурами, возраст от 6 до 25 тысяч лет. Анализ клоновых библиотек архейных генов 16S рРНК и mcrA показал, что во всех исследованных образцах археи филума Euryarchaeota преобладали над представителями Crenarchaeota. Метаногенные археи были представлены новыми таксонами порядков Methanomicrobiales, Methanobacteriales, Methanococcales и Methanocelles.

Выделены и описаны новые таксоны анаэробных бактерий и архей из различных мест обитания:

• 4 рода, 8 видов бактерий из микробиома человека;

• 6 видов бактерий из содовых озер;

• 1 род и 4 вида бактерий из глубинной биосферы и морских экосистем;

• 5 видов бактерий и 3 вида архей из образцов вечной мерзлоты Арктики.

Получены приоритетные данные подтверждающие возможность выживания метаногенных архей в условиях космоса:

При длительной экспозиции (24 мес) метаногенных архей Methanosarcina mazei S-6^T на внешней стороне Международной космической станции (МКС) сохранилась жизнеспособная популяция клеток археи. На основании полученных результатов можно сделать вывод о наличии в геноме метаногенной археи M. mazei S-6^T протекторных механизмов от воздействия факторов космического пространства в том числе таких, как вакуум, УФ-облучение и перепады температур.

В лаборатории поддерживается в жизнеспособном состоянии часть фонда ВКМ

более 500 штаммов трудно культивируемых видов анаэробных бактерий и архей, в основном, выделенных из экстремальных мест обитания.

Речкина В., научный сотрудник лаборатории анаэробных микроорганизмов участвует в отборе проб вечной мерзлоты на Чукотке. Экспедиция лаборатории криобиологии почв (рук. Ривкина Е.М.) ИФХиБПП РАН.

Опубликовано 140 статей; защищено 4 кандидатских диссертаций и 1 докторская диссертация. Получено 3 патента. Выполнено 16 проектов по грантам международных и российских фондов, соглашениям Минобрнауки.